B Bandar Udara merupakan gerbang utama yang didatangkan oleh banyak orang sehingga bangunan Bandar Udara dibuat nyaman berkegiatan didalamnya, flow bagi kendaraan yang datang dibuat satu arah melewati drop off, yang bagi orang ingin berangkat langsung naik lantai satu melalui escalator maupun lift. Dan bagi orang kedatangan berada dilantai dasar sekalian mengambil bagasi. Didasar disediakan gedung VIP yang dikhususkan bagi orang-orang penting, agar tidak memakan waktu banyak gedung VIP langsung dekat menuju apron.Bangunan Bandar Udara Mali Alor ini memiliki struktur segitiga memakai baja komposit yang dapat membuat area didalam ruangan lantai satu bebas kolom dan terkesan luas, demi memenuhi kebutuhan pengguna bangunan. Pencahayaan alami yang dapat melalui sisi bangunan agar bangunan mendapatkan ekstra penuh bagi pencahayaan, lantai dasar dibuat terbuka demi menerapkan konsep masyarakat Pulau Alor „liktaha‟ yang berarti ruangan tanpa sekat yang diperuntukan bagi area drop off dan plaza yang dibikin sebagai waving gallery bagi pengunjung yang datang agar bisa menikmati area ditengah bangunan Bandar Udara Mali Alor ini.