P Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis faktor-faktor penyebab inkonsistensi antara keputusan keberatan dan putusan banding dalam sengketa pajak terkait pembayaran royalti kepada pihak afiliasi. objek penelitian terdiri dari 90 putusan banding pada periode 2020–2024. metode yang digunakan adalah studi kasus dengan pendekatan kualitatif, serta teknik pengumpulan data melalui dokumentasi dan wawancara dengan 20 informan, meliputi penelaah keberatan, hakim pengadilan pajak, akademisi, dan kuasa hukum.hasil penelitian menunjukkan bahwa keputusan keberatan yang mempertahankan koreksi pemeriksa pajak dipengaruhi oleh kurangnya bukti memadai dari wajib pajak, keterbatasan pemahaman dan pengalaman penelaah keberatan, tekanan waktu, tekanan kelembagaan, serta isomorfisme mimetik, sedangkan isomorfisme normatif tidak berpengaruh. sementara itu, putusan banding yang mengabulkan permohonan wajib pajak lebih dipengaruhi oleh kuatnya pembuktian, kompetensi, dan independensi hakim pengadilan pajak, dengan keterbatasan waktu, isomorfisme mimetik dan normatif tidak berpengaruh jelas. inkonsistensi antara kedua putusan ini disebabkan oleh perbedaan standar penerimaan bukti, kompetensi pihak yang memutuskan, dan tingkat independensi lembaga keberatan dan pengadilan pajak.penelitian memberikan solusi perbaikan yang dapat diterapkan pada lembaga keberatan, meliputi peningkatan kompetensi penelaah keberatan, penerapan teknologi, reformasi indikator kinerja, dan reorganisasi lembaga keberatan untuk meningkatkan profesionalisme dan independensi dalam proses penyelesaian sengketa pajak. dengan demikian, potensi sengketa pajak terkait pembayaran royalti kepada pihak afiliasi dapat diselesaikan secara optimal pada tahap keberatan, sehingga sengketa pajak yang berlanjut ke tahap banding dapat diminimalkan.